الأول: قسم الأعيان.
الثاني : قسم الحسابات.
الثالث : قسم الأرشيف.
ومدير المكتب هو المسئول الأول على هذه الأقسام الثلاثة وكل قسم من هذه الأقسام الثلاثة المذكورة له مسئول عنه فمدير مكتب الأوقاف والإرشاد م/ القطن هو الأخ/ خميس عوض دهلوس ومسئول قسم الأعيان بالمكتب هو الأخ/ جمعان سالم علي باخميس ومسئول قسم الأرشيف والضابط الإداري بالمكتب هو الأخ/ خالد عاشور عباد ومسئول الحسابات الأخ/ ربيع سالم الحمد.
والمكتب يعمل دائماً على تنفيذ قرارات المكتب التنفيذي وكذا المجلس المحلي م/ القطن إلى جانب ذلك التعاميم والتكليفات من إدارة الأوقاف والإرشاد بالوادي والصحراء وكذا وزارة الأوقاف والإرشاد فيما يتعلق بأراضي الأوقاف وكذا عقود الإيجار تجارية أو سكنية أو زراعية بالإضافة إلى الاهتمام بالمساجد والمقابر وتنظيم الملفات والسجلات وتدوين جميع المعلومات فيها ومتابعة تنفيذ الخطة السنوية للمكتب المرفوعة للإدارة العامة وحضور الاجتماعات الدورية والطارئة من أجل تفعيل العمل وتقديمه بشكل صحيح وسليم. وكذا المساعدة والتذليل للمحسنين الخيرين في بناء المساجد أو ترميمها وكذا توريد مستلزمات المساجد من مصاحف وأثاث وكتب وغيرها.
وبالنسبة للمشاريع المستقبلية فيطمح المكتب إلى بناء إدارة مستقلة في أرض الوقف على أن يتم استغلال بدروم الأرضية مستودعات والطابق الأول محلات تجارية يعود عائداتها لمصلحة الوقف والدور الثاني مكاتب إدارة الأوقاف والإرشاد بمديرية القطن ، ومن المشاريع التي يطمح إليها المكتب هو تسوير المقابر في المديرية واستغلال أراضي الأوقاف الواقعة على الخط العام.